由于自動對焦速度極快，準確性高，佳能數(shù)碼單反的對焦系統(tǒng)一直被用戶所稱道。從第一臺EOS相機至今，佳能一刻不停地發(fā)展著自己的對焦系統(tǒng)。在2007年，投放市場的EOS-1D Mark III，裝載了19個十字型自動對焦點f/2.8時和26個輔助自動對焦點，能在昏暗的環(huán)境中成功對焦，十分強大，在體育、新聞攝影師中廣受贊譽。

除對焦點之外，自1989年在EOS 630上首次應用的高速人工智能伺服自動對焦（AI SERVO）功能，還能讓相機連續(xù)不斷地對最近距離內的主體進行偵測。尤其是運動主體，即便在有前景干擾的情況下，也能準確跟蹤，保證無論什么時候按下快門，相機都會對主體成功合焦，非常適合體育、新聞拍攝以及記錄好動的孩子、寵物等。