當你用手動對焦的時候，只要把鏡頭上的對焦模式鈕撥到MF檔，或者將機身下面的那個對焦模式選擇（C/S/M）撥到M位置都可以。
對于AF-S即超聲波對焦馬達鏡頭而言，這而處M檔只要有一處選在了M處，即使另一處在A或者C/S上也不能實現自動對焦。同時對相機和鏡頭也是沒有什么損害的。

D90的確可以指揮兩套對焦動力系統，一種在機身內，馬達通過一個小旋軸通過鏡頭卡口向AF鏡頭傳遞對焦動力。
另一種準確地說動力是在AF-S鏡頭內，相機只是通過鏡頭卡口上的電觸點，與鏡頭進行數據通訊，“指揮”其行動。
但AF-S鏡頭不同于AF鏡頭，是沒有接受機身卡口上的旋軸的機械承接軸的。
兩種鏡頭的機械傳動設計是完全不一樣的。
所以，當你機身設為AF，但鏡是MF狀態(tài)，此時鏡頭對焦馬達的離合器是脫離狀態(tài)的，鏡頭也就無法自動對焦了。
而你其望的所謂“此時機身對焦馬達啟動"，實際上也是不可能的，因為機身就根本無法把對焦動力傳給AF-S鏡頭，機身對焦馬達只能給老的AF鏡頭提供動力。
D40、D3000、D5000機身內沒有對焦馬達，所以只有使用AF-S鏡頭才能實現自動對焦功能。

AF50/1.8、AF50/1.8D都是非AF-S鏡頭，它們在D40、D3000、D5000這樣的機身上是無法自動對焦的。但D90以上的型號都可同時支持AF和AF-S鏡，所以它們在d90上也能實現自動對焦。
只不過由于對焦方式的不同，它比AF-S的對焦速度要慢些、聲音要大些。